Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan11Q9D1D1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms