Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps28Q9D1C8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms