Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NkapQ9D0F4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NkapQ9D0F4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NkapQ9D0F4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NkapQ9D0F4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NkapQ9D0F4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NkapQ9D0F4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NkapQ9D0F4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NkapQ9D0F4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NkapQ9D0F4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms