Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ndc80Q9D0F1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ndc80Q9D0F1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ndc80Q9D0F1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndc80Q9D0F1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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