Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shmt2Q9CZN7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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