Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms