Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gins3Q9CY94 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gins3Q9CY94 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gins3Q9CY94 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Gins3Q9CY94 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins3Q9CY94 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms