Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd4Q9CWX4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpusd4Q9CWX4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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