Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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