Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ska2Q9CR46 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ska2Q9CR46 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms