Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer1Q9CQL2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms