Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubl4bQ9CQ84 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubl4bQ9CQ84 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms