Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms