Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms