Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms