Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt23Q99PS0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms