Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd3Q99PL7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scd3Q99PL7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms