Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rassf3Q99P51 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rassf3Q99P51 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms