Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mrpl3Q99N95 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Mrpl3Q99N95 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Mrpl3Q99N95 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Mrpl3Q99N95 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Mrpl3Q99N95 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Mrpl3Q99N95 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mrpl3Q99N95 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Mrpl3Q99N95 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl3Q99N95 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Mrpl3Q99N95 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms