Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SncaipQ99ME3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms