Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms