Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nmd3Q99L48 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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