Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmp1Q99KU0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmp1Q99KU0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms