Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms