Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms