Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms