Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim7Q923T7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim7Q923T7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms