Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms