Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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