Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms