Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klc3Q91W40 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Klc3Q91W40 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms