Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx9Q91VH2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms