Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIB5

Barhl2, BarH-like 2 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl2Q8VIB5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl2Q8VIB5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms