Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms