Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms