Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms