Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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