Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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