Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsl1Q8K305 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms