Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

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Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mrpl47Q8K2Y7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mrpl47Q8K2Y7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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