Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms