Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms