Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Csnka2ipQ8CH19 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Csnka2ipQ8CH19 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Csnka2ipQ8CH19 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Csnka2ipQ8CH19 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Csnka2ipQ8CH19 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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