Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd1bQ8CFT2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Setd1bQ8CFT2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms