Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Hpf1Q8CFE2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Hpf1Q8CFE2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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