Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh13Q8CEE7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rdh13Q8CEE7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rdh13Q8CEE7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rdh13Q8CEE7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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