Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms