Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Lrif1Q8CDD9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrif1Q8CDD9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Lrif1Q8CDD9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms