Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn5Q8CBA2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn5Q8CBA2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms