Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc159Q8C963 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc159Q8C963 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms